西安事变后，杨虎城的第17路军被精简为第38军，孙蔚如担任军长，赵寿山担任师长，孔从洲则被任命为旅长。孔从洲是西安事变中担任西安城防司令的将领，蒋介石对他采取了拉拢策略，因此让他担任了旅长职务。

1943年1月，国民党新编的35师师长孔从洲正在前线与日军激战，突然收到蒋介石发来的电报，要求他离开前线，前往重庆面谈。由于孔从洲不清楚蒋介石召见的具体原因，他无法提前准备。到达重庆后不久，孔从洲便被带到蒋介石所在的黄山官邸。蒋介石见到孔从洲后，立刻批评他丢失了黄河铁桥，并情绪激动地表示要对孔从洲进行军阀式的惩处。孔从洲感到自己不应该对黄河铁桥的失守负责，于是据理力争，告诉蒋介石，黄河铁桥并非他们师丢失的，而是他们接防时，黄河铁桥的邙山已经失守，监交人员可以为他们证明。然而，蒋介石并不听孔从洲的解释，依然坚持认为责任在他，且愤怒地说：我不管，我不管，就是你们失的！你不要再说了，就是你们失的！孔从洲见蒋介石如此固执，也便不再争辩。

稍后，蒋介石情绪稍微平静后，看着孔从洲问道：你和孔祥熙是孔门同辈后裔，你家是做什么的？孔从洲听后心里暗自发笑，但忍住了没有笑出声。如果自己家真有像孔祥熙那样的财力，也不会在小时候遭到地主孩子的欺负了。孔从洲的女儿回忆道：父亲是西安灞桥的桥梓口人，小时候家境贫困，上学时常常买不起饭，吃的只是自己带的玉米面馍，学校传达室的工友同情他，会把煮面的面汤打给他配着吃。有个地主家的孩子经常欺负他，把他的面汤打翻，当时父亲气愤却无奈。后来，家里的地也被人侵占，打官司没钱也打不赢，导致父亲失去了继续读书的机会，最终不得不辍学回家。社会的不公促使他立下决心，要投身军队，想借此改变命运，同时办一所学校，给贫困家庭的孩子们提供读书的机会。1924年，孔从洲得知杨虎城的部队招收学兵，不收学费，还管吃管穿，便与几位同学一起去报名，并顺利考入了军事教导队，正式成为一名军人。那时，他年仅18岁。

孔从洲一直很尊敬杨虎城，在他眼中，杨虎城是一个劫富济贫的豪杰，他的部队代表了贫苦百姓的利益。因此，孔从洲在杨虎城的部队中一直表现得非常英勇，并逐渐晋升，先后担任了排长、连长、营长、团长等职务。1932年冬天，孔从洲回家探亲时，看到家乡的学校依旧破旧不堪，许多孩子辍学，唯一的老师甚至连工资都没有，孔从洲感到十分痛心。他决定为家乡办学，便请来几位村里的长辈商议此事。他自己拿出了积蓄的300元作为启动资金，并承诺承担大部分的运营费用。村里的长辈们非常支持他，选出了几位德高望重的人担任董事，最终创办了学校，并命名为竞进小学，寓意在竞争中求进步，鼓励大家不断奋斗和努力。后来，孔从洲还在附近创办了务庄小学，给更多的孩子提供了接受教育的机会。在与学校的校长们交流时，孔从洲强调，办学的目的是培养人才，传播新文化和科学知识，改变家乡文化的落后面貌，倡导艰苦创业和积极进取的校风。

为了确保学校顺利运营，孔从洲尽可能每年抽时间回乡查看学校情况。如果实在抽不开身，就让校长或老师到西安来解决问题。1936年，孔从洲被任命为国民革命军第17路军警备第2旅的旅长，成为了杨虎城的心腹。此后，他又兼任西安城防司令。在西安事变中，孔从洲按照杨虎城的命令，打响了第一枪，并迅速完成了清除蒋介石嫡系卫队和特务武装的任务，得到了杨虎城的赞扬。西安事变和平解决后，第17路军被改编为第38军，孔从洲继续担任旅长。1938年，孔从洲奉命率部东渡黄河，守卫永济。孔从洲在回忆永济之战时提到：那是我与日军的第一次交手，也是第一次面对装备现代化的敌军，最终以四五百人的代价，伤敌千余，取得了首战胜利。然而，在随后的中条山战役中，孔从洲率部被日军包围，情况非常危急。

为了解围，孔从洲组织了敢死队，利用日军在夜间的疲惫发起了猛攻。在这场战斗中，孔从洲的部队歼灭了日军的两个炮兵中队和后方医院，取得了显著的胜利。随后，其他部队也纷纷向日军发动攻击，最终将敌军驱逐出了中条山。当第38军军长赵寿山见到孔从洲时，称赞他说：好你个小个子，真成了常山赵子龙了！像诸葛亮说的，各部都有伤亡，只有子龙一人没失一骑！在换防后，孔从洲被任命为新编35师的师长，负责黄河防线的防守。

1943年1月，蒋介石召见孔从洲到重庆问话。在问到孔从洲家境时，孔从洲回答说：我和孔祥熙不认识，家境差得远了，我家是做农活的。蒋介石继续问他：你是做什么的？孔从洲答道：我是军人。接着，蒋介石又问：平时看什么书？孔从洲答：我看兵法、史书、总理遗教、委员长言论集，还看委员长的庐山讲话、四大教程和典范令。当蒋介石得知孔从洲还看《孙子兵法》和《曾胡治兵语录》时，对此产生了浓厚兴趣，两人聊了很久。蒋介石对孔从洲的回答显得很满意，最终答应调拨一批军用物资给孔从洲的部队。然而，蒋介石对孔从洲的部队并不十分看重，认为它是杂牌部队，孔从洲的部队境况依旧艰难。 1946年5月，孔从洲率部在河南巩县起义。不久后，中共中央决定重新组建38军，孔从洲被任命为军长。最终，在毛主席的亲自批准下，孔从洲加入了中国共产党，成为一名高级军事指挥员，完成了自己的人生蜕变。