杨秀清假托天父下凡的初衷真是出于忠心、公心
金田起义以后，虽然肖朝贵战死长沙城下，但杨秀清一直以东王之尊掌握太平军兵权，并经常借“天父下凡”与天王洪秀全争夺权力，双方的争斗一直延续到定都南京以后。随着这一矛盾的不断激化，最终导致天京内乱，杨秀清等数万将士死于非命，实力强大的太平军也在这次内讧中逐渐走向了衰落。
由于杨秀清后期的专横表现，很多人将其当初与肖朝贵假借天父天兄下凡的举动，视作阴谋夺权、实现个人野心的一种伎俩。但实际上，无论杨秀清后期表现如何，在1848年他最初搞附体传言这一套的时候，应该是真心为了维护拜上帝会的团结，没有太多的私心杂念掺杂在里面。
地主攻于外，内部闹分裂1848年1月，紫荆山区的恶霸地主王作新以“结盟藉拜上帝妖书，践踏社稷神明”“阳为拜教，阴图谋叛”;“先打神后打人，争王夺国”等吓死人的罪名，将洪秀全最得力的两个助手——冯云山、卢六逮捕入监。洪秀全“即自回广东，意欲入禀总督请求释放因信教而入狱之两友”。
当时，地主团练气焰十分嚣张，扬言要铲除上帝会，杀绝拜上帝佬。不久，卢六在牢中被摧残至死的消息传来，拜上帝教徒们人心惶惶，“心无定见”；有“忘却真道，差入鬼路”的危险。与此同时，拜上帝会内部也一度陷于混乱状态，许多人都各自行其是，互争雄长，谁也管不了谁，拜上帝会随时有分崩离析的危险。
甘冒杀头风险挺身而出在这危急关头，杨秀清，肖朝贵二人临危不惧，挺身而出，假托天父天兄下凡，安定众心，并营救冯云山出狱。据载：“戊申岁三月，天父大开天恩，亲身下凡，出头作主，托东王金口教导兄弟姐妹”，不必惊慌，不可动摇。肖朝贵则以耶稣之名传言，与杨秀清相互配合，迅速稳定了人心。
1848年至1849年之间，冯云山被捕入狱，洪秀全又返回广东。当时的拜上帝会是一个不合法的政治宗教团体，清政府的打击非常严酷，轻则鞭笞坐牢，重则充军杀头。既无权可争，无位可夺，也无钱无势，无利可图。长达1年多的时间里，拜上帝会大多数人都不敢冒风险，站出来负起领导责任。但杨、肖二人急中生智，挺身而出，充当拜上帝教的领导人，使尚在酝酿中的太平天国革命转危为安。
由此可见，杨、肖二人不怕坐牢杀身之祸，能够站出来假托天父天兄下凡附体来重聚人心，其初衷肯定不是争权夺利，而真的是出自对拜上帝教事业的耿耿忠心。