在1946年，即全面内战爆发前夕，国共两党曾进行了一系列和谈，并达成了一些相关的和平协议。其中有一项重要内容是关于整编全国军队的方案，旨在国共两党分别对各自的军队进行裁减与整编，从而维持国家的和平稳定。

蒋介石虽然同意了这一整军方案，但他心中一直藏有打压共军的打算。对于他而言，整编军队的目的并非真正为了和平，而是为了削弱共军的力量，并在此过程中为即将到来的战斗做准备。他的真正意图，一直是要彻底剿灭共军。然而，蒋介石未曾预料到的是，整编过程中，他自己的军队反而首先遇到了问题。

1946年2月底，经过多次商讨，国共双方终于就整编军队达成一致，并签署了相关协议。这份协议明确指出，整个军队的整编工作将分为三个阶段。第一阶段，持续半年，国共双方各自进行整编；第二阶段同样为半年，国共军队分别裁减至90个师和18个师；到了第三阶段，双方的军队将被精简到各自的50个师和10个师。对于中共来说，这显然是让步，但蒋介石依然不满。他一直希望能彻底掌控中共的军队。

当蒋介石在对待共军得到18个师的结局表示不满时，国民党军队内部却开始出现严重的问题。根据当初的整编方案，国军需要将集团军缩编为军，军再缩编为师，并在裁减一个团的兵力后编成旅。按照此计划，国军整编后的90个师将与中共的18个师合编成36个军，而整编后的番号将控制在36以内。举个例子，原先的第10集团军将改为第19军，抗战中的“抗日铁军”74军则被改编为整编第74师。虽然在其他军队中，变更番号是普遍现象，人员变动也是正常的，但这种变动在国民党内部却掀起了巨大的风波。

国民党派系纷争严重，番号的变化看似无关紧要，但却引发了许多人对队伍变化的不满。例如，国民党五大主力之一的18军，曾是陈诚集团的核心部队，自称“土木系”，而这一部队在整编后被更改为第11师，不再被视作完整的“土木系”，并且人员发生了较大流动。即便是蒋介石的嫡系部队也未能幸免，其他“杂牌军”更是感到不满，导致国民党内部矛盾重重。

此外，由于部队要进行缩编，人员必然会减少，但蒋介石如何能够忍心裁减那么多自己的部下呢？早在1946年元旦，蒋介石就提到了整编军队的计划，并在政协会议上提出要将当前的380多万步兵裁减至180万人。然而在随后的国共讨论中，双方达成的共识是每个师的兵力不超过1.4万。这意味着即使进入整军第二阶段，国军缩编为90个师时，实际人数也远少于180万。最终进入第三阶段时，国军的总人数甚至可能不超过百万。对此，国民党内部对大规模裁减士兵的做法表示极大不满，但蒋介石的算盘并非真的要进行裁军。

实际上，蒋介石提出的“军编为师、师编为旅”的命令并非简单的缩编，而是为掩人耳目，暗地里进行扩充兵力。虽然国军在某些部队更改了番号，但并没有进行大规模裁员，而是通过换人，替换掉了老弱病残，吸纳了大量精壮青年。甚至一些部队提出增加兵力的要求，例如第16军要求增加六千多人，第3军要求增加九千多人。此外，被裁减的部分士兵并非完全遣散，而是通过“转业计划”安置到工厂、交通等部门，实际上这些人依然在一定程度上维持着与军队相似的工作环境。

同时，国民党还将一些伪军纳入国军，甚至将他们任命为副军长等职务。尽管蒋介石为确保实力不受削弱，做出了这些调整，但一些非嫡系的军官却在整编后成为了“编余人员”，他们被迫离开军队，而当时的社会经济形势也让这些编余人员难以维持生计，导致他们对蒋介石产生强烈的怨气。部分编余军官甚至表示要投靠中共。为了避免这些军官为共军所用，蒋介石开设了将官班，打算将这些人再度培训，但由于他们大多缺乏特长，工作安置起来困难重重，致使他们的情绪越来越激烈。

这些编余人员的不满情绪在某个时刻爆发了。1947年初，数百名编余军官在南京秘密召开会议，商讨如何反抗。当时，愤怒的军官们决定效仿传统戏剧中的“哭祖陵”一幕，前往孙中山先生的陵墓，举起国民党党旗，在祭文结束后放声大哭。这一事件引起了社会的巨大轰动，蒋介石原本想通过杀掉带头的军官来震慑他们，但考虑到战时局势，他最终决定妥善安置这些军官，让他们或是转岗地方，或是进入军校深造，从而平息了风波。

从此次整编事件中可以看出，国民党内部不仅存在着严重的派系争斗，而且对士兵和军官的管理也非常混乱，完全失去了团结的力量。这样一支只注重派系权力、忽视军心士气的队伍，怎能战胜上下齐心的共军呢？