1248年,贵由去世后,其遗孀斡兀立·海迷失宣布代摄大汗之职。她原本有两个选择:一是将汗位传给窝阔台系的王子——她的侄儿失烈门,二是传给她和贵由的亲生儿子忽察(当时尚年幼)。然而,作为成吉思汗家族的最高领导者,拔都的意见深刻影响了事态的发展。拔都联合拖雷的遗孀唆鲁禾帖尼,共同排挤窝阔台系的势力,最终推举拖雷与唆鲁禾帖尼所生的长子蒙哥继位。1250年,库里勒台大会在拔都的阿拉喀马克营地召开,拔都正式提名蒙哥继任大汗。
然而,尽管拔都采取了积极的推动举措,支持者的票数却并不充足。术赤家族和拖雷家族投票支持蒙哥,而窝阔台家族与察合台家族的代表则以参选人数不足为由拒绝投票。为了让选举更加公平,且至少让反对者保持沉默,拔都决定在更具历史意义的蒙古圣地召开一次人数更多的库里勒台大会。虽然窝阔台和察合台的成员拒绝了他的邀请,但他们的反对并未能改变大局。最终,1251年,拔都委托自己的弟弟别儿哥重新组织了库里勒台大会。尽管窝阔台家族和也速蒙哥反对,蒙哥最终仍被推举为大汗。 这场政变之所以能够顺利完成,背后有几个原因:首先,拔都作为成吉思汗长支的首领,掌握了相当大的权力,特别是在大汗之位空缺时,处于一种近乎独裁的地位;其次,蒙哥本人是个典型的强者,而正统的窝阔台家族的王子们虽然年轻,但并未受到普遍尊敬。然而,拖雷家族的篡位,毕竟是对传统正统的挑战,因此难免会引发反抗。窝阔台家族的成员试图在库里勒台大会结束前推翻蒙哥,但他们的阴谋败露,最终他们的军队被缴械,谋士们也被处死,包括合答黑和镇海在内,而这些反叛者最终全部被俘。 蒙哥并未对这些反叛势力手软,他对窝阔台家族的成员展开了严厉的惩罚。摄政皇后斡兀立·海迷失在被剥去衣服受审后,被缝进袋子中沉入水中淹死;失烈门从中国出征归来后,也同样被投进水中淹死;贵由年幼的儿子忽察则被流放至哈拉和林以西的偏远地区。唯一因主动投降而被赦免的,是合丹和海都,他们得以保留自己的封地。与此同时,蒙哥还处死了察合台家族的首领也速蒙哥,并决定由该家族的另一个王子哈剌旭烈兀取代他的位置。察合台的孙子不里,由于在欧洲战争中对拔都的领导表示不满,最终被蒙哥交给拔都处决。