秦始皇的生父存在两种观点，一种观点认为是秦庄襄王（嬴异人），另一种观点认为是吕不韦。

• 认为是秦庄襄王的依据：
• 秦国的宗法制和官方认证：秦国自秦孝公以来就实行严格的宗法制度，对于王室血脉的纯正性有着极高的要求。在这样的制度下，如果秦始皇的身世存在疑问，很难顺利继承秦王之位。而且秦国宫廷有专门主管王室事务的官员，王室子弟出生后，官员会严格审查其血统是否纯正，然后下发类似身份证明的东西。秦始皇能够继位，说明他在王室层面是被认可的王室成员。
• 时间逻辑难以成立：按照《史记·吕不韦列传》的记载，赵姬是“至大期时，生子政”。“大期”一般被解释为十个月或十二个月，如果赵姬在被献给异人之前就已怀孕，那么从怀孕时间上看很难瞒过众人。古代医学条件较差，妇女通常在妊娠两个月后才能发现自己怀孕，吕不韦知道赵姬有身孕时，赵姬恐怕已有两月身孕，若要使秦庄襄王察觉不到迹象，那么赵姬起码要怀孕十二个月，这几乎是不可能的事。
• 史料的可靠性：《史记·秦始皇本纪》中明确记载“秦始皇帝者，秦庄襄王子也”。虽然《史记》在同一问题上有不同的记载，但《秦始皇本纪》是根据秦国官方档案文书写成，相对来说更为谨慎严肃，其关于秦始皇生父是秦庄襄王的记载更具可靠性。
• 认为是吕不韦的依据：
• 《史记·吕不韦列传》的记载：吕不韦与邯郸女子赵姬同居，知道她有了身孕。子楚（异人）在吕不韦家宴上看到赵姬后很喜欢，就请求吕不韦把她送给自己。吕不韦起初很生气，但考虑到已经为子楚投入了很多，想要钓奇获取更大的利益，就把赵姬献给了子楚。后来赵姬生下了嬴政。这段记载是秦始皇生父为吕不韦这一说法的主要来源。
• 政治动机的猜测：吕不韦是一个极具政治野心的人，他把赵姬送给异人，有可能是想通过这种方式在秦国王室留下自己的血脉，以便日后更好地掌控秦国朝政。而且吕不韦在异人成为秦王后，获得了极高的政治地位和权力，这也被一些人认为是他“谋国”计划的一部分。

至于古代君王中为何只有秦始皇的身世极富争议，主要有以下原因：

• 特殊的历史背景和人物关系：
• 战国后期，秦国日益强大，即将统一六国，秦始皇作为这一关键历史时期的重要人物，其身世自然备受关注。而他的母亲赵姬曾是吕不韦的姬妾，后来又被吕不韦送给异人，这种复杂的人物关系为身世争议提供了土壤。
• 吕不韦作为一个大商人，却成功地扶持异人成为秦王，自己也成为秦国的相国，他的政治影响力和与秦始皇的特殊关系，容易引发人们的猜测和联想。
• 政治斗争和舆论攻击的影响：
• 秦始皇统一六国后，实行了一系列激进的改革措施，得罪了不少既得利益者。这些人为了贬低秦始皇，很可能故意散播关于其身世的谣言，以达到抹黑其形象的目的。
• 秦国在统一过程中，与山东六国结下了深厚的仇恨。六国在战场上打不过秦国，便在舆论场上进行攻击，造谣秦始皇是吕不韦的儿子，这样可以破坏秦国统治的正统性，从心理上获得一种安慰。
• 历史记载的模糊和矛盾：《史记》作为重要的历史文献，在秦始皇身世的记载上存在矛盾之处。《史记·秦始皇本纪》明确说秦始皇是秦庄襄王的儿子，而《史记·吕不韦列传》中却有赵姬怀孕后被献给异人的记载，这使得后人对秦始皇的身世产生了疑问。

总之，秦始皇的身世之谜是一个复杂的历史问题，由于史料的有限性和矛盾性，以及历史背景和政治因素的影响，至今仍没有定论。但无论秦始皇的生父是谁，都不能否认他对中国历史的巨大影响。