哈密自古以其“西域襟喉，中华拱卫”的战略地位而著称。东接河西走廊，西连西域诸镇，成为中央王朝欲掌控西域的关键之地。自古以来，任何要统治西域的中央政权，都不得不首先控制哈密。1697年，哈密的封建领主额贝都拉选择归降清朝，此举不仅标志着哈密的政权变动，也为清朝确立了对这一重要地区的统治。清朝一方面派遣地方官员治理，另一方面将哈密封地交由历代“哈密回王”管理。哈密回王的世系更替大致如下：

1697至1709年，由额贝都拉担任札萨克一等达尔汗，接着在1709年至1711年，由其子郭帕继承王位。此后，额敏继任，从1711年一直至1740年，获得镇国公及固山贝子的加封。此后，玉素甫于1740年继位，并于1766年获得郡王品级以及封多罗贝勒。接下来的王位传承依次是伊萨克（1767—1780年）、额尔德锡尔（1780—1813年）、伯锡尔（1813—1866年）、迈哈默特（1867—1881年）以及沙木胡索特（1882—1930年）。沙木胡索特于1930年去世后，由其子聂孜尔继位，但聂孜尔的统治在短短三年后便宣告终结，哈密回王的世系由此灭绝。

史籍记载，哈密回王的世系最初源于阿拉伯人，也有说法称他们是成吉思汗的后裔。这个家族曾辗转迁徙至伊犁、哈密等地，最终在哈密建立了政教合一的政权。尽管起初其势力微弱，仅能号召“马数十匹、从者数十人”，但凭借“圣裔”与“白骨头”等自称高贵血统，他们逐渐巩固了自己的统治地位。哈密最初隶属于叶尔羌汗国，曾领导民众抵抗西蒙古准噶尔部的入侵。然而，在1678年，叶尔羌汗国被准噶尔部灭亡后，额贝都拉选择投降，成为准噶尔部的附庸。起初，额贝都拉被迫提供兵员和粮食，屡受压榨。每当清朝使者经过哈密，他便以殷勤的态度示好，期望得到清朝的庇护。有一次，清朝使团在准噶尔部的劫持下几乎被全体屠杀，正是额贝都拉出手相救，使得清廷对其忠诚有了深刻印象。随后，康熙皇帝调动大军与准噶尔部激战，并最终成功击败噶尔丹的部队。此时，额贝都拉便选择投降清朝，成为哈密回王的首任领导。

当清军在1755年彻底消灭准噶尔汗国后，玉素甫作为哈密回王的继承人，在乾隆帝面前展现出忠诚，得到了乾隆帝的赏识，晋封为和硕贝勒，并被授予多罗郡王的封号。在玉素甫去世后，由其次子伊萨克继承王位。1780年，伊萨克将王位传给长子额尔德锡尔，清廷此时也正式认可哈密回王的爵位世袭制度。

哈密回王伯锡尔继位后，他在1820至1827年的张格尔之乱中贡献显著，帮助清廷平定叛乱，得到道光帝的赏识。时至咸丰帝时期，伯锡尔继续受到宠遇。然而，随着阿古柏入侵新疆，哈密回王的统治开始面临严峻挑战。虽然伯锡尔顽强抵抗，最终他还是在1866年被敌军俘虏，并誓死不降。其妻子在战乱中不幸死亡，伯锡尔也因此被追封为“亲王”。

伯锡尔死后，由其子迈哈默特继位。然而，迈哈默特因病无法履行职责，实权掌握在伯锡尔的妻子手中。这位女性先前曾被叛军掳至南疆，直到1877年清军收复南疆才得以回归哈密。在迈哈默特无后嗣的情况下，这位女性支持女婿沙木胡索特成为王位继承人。1882年，沙木胡索特得到了清朝的承认，成为“亲王”。此时，哈密回王的权力已经达到了顶峰，然而随着内部专制和民众压迫的加剧，王府的统治日渐腐化。

随着1907年哈密王府煤矿的事故爆发，民众的反抗情绪达到了高潮。农奴矿工的死于事故后，王府没有给予任何抚恤，反而继续剥削劳动者，最终引发了由札加甫兄弟领导的暴动。尽管起义最终因清军镇压失败而告终，但它对哈密回王的统治造成了极大震动。1911年辛亥革命爆发后，哈密的农民起义再度爆发，回王的统治再次受到挑战。

随着袁世凯掌握权力，沙木胡索特在与杨增新等人的勾结下重拾权力，甚至前往北京全力支持袁世凯称帝。尽管沙木胡索特试图通过这种方式保住自己的特权，但袁世凯的帝制仅维持了百日，沙木胡索特失望返回哈密。最终，沙木胡索特的权力在经过一系列波折后彻底崩塌。1930年，他在孤独中去世，标志着哈密回王的统治彻底灭亡。

聂孜尔继位后，尽管他四处煽动，企图恢复王位特权，但哈密地方的局势已然动荡。经过两年激烈的冲突，哈密回王府的统治完全崩塌。1933年，聂孜尔最终自尽，标志着哈密回王的统治彻底结束，世袭统治长达233年的历史画上了句号。