1952年，孙毅被调任为华北军区副参谋长，协助当时的参谋长杨成武工作。尽管这一职务并不低，但在副参谋长的任期内，他却经历了多次尴尬局面，这让他常常感到心情复杂，甚至有人在背后议论他管理能力不足，究竟发生了什么事情呢？

众所周知，在新中国成立后，国家设立了六大军区，分别是东北军区、华北军区、华东军区、中南军区、西北军区以及西南军区。这六大军区的司令员大多数都是革命时期的老将领，他们的地位和权威与1955年建立的12大军区有显著的不同。

虽然孙毅担任华北军区的副参谋长，论级别也是非同一般，属于副兵团职务。与1955年北京军区的副参谋长相比，他的职务级别并不低，甚至可以说是更高。彼时，华北军区的司令员是聂老总，他同时担任代总长，工作重心主要放在总参议，对军区日常事务则由杨成武负责。杨成武的革命经历比孙毅更为悠久，自1931年宁都起义以来一路前行。尽管孙毅在红军时期的职位高于杨成武，曾任师参谋长和军团参谋长，但两人都是在聂老总的领导下共同作战过的战友，彼此间非常熟悉。

在孙毅担任副参谋长期间，他经常深入部队进行实地考察，关注军务、人民武装建设等情况，并在总结后将信息汇报给军区首长以便做出决策。在部队的观察中，他确实发现了不少亟待解决的问题，但由于对决策的谨慎态度，不敢当场下决策，通常只能把问题带回去汇报后再行回复。因此，一些基层干部对孙毅的工作产生了误解，认为他在现场无法决策，不具备解决问题的能力。

孙毅对此现象有着深刻的体会，作为一名副职，他在工作上确实受到很多限制。上面有军区的司令员和参谋长，如果自己草率行事，越权做决定显然是不妥当的，至少要让主要领导知晓，不能随便决定。反观参谋长的角色，情况就不同了。当时军区没有副司令员的设置，因此除了军区司令员，参谋长就成为了实际上的决策者，他可以在司令员缺席时当场“拍板”处理问题。

六大军区的司令员大多是各路老将，例如彭总、聂老总、陈老总、贺老总和林总等，他们都承担着军区以外的工作，这使得参谋长不得不兼任副司令员的角色。西北军区的彭绍辉、西南军区的李达、华北军区的杨成武和东北军区的贺晋年都是如此。华东军区的张爱萍因拒绝兼任副司令，故而仅担任参谋长。

随着时间的推移，基层单位的人员越来越普遍地认为参谋长更具权威，而副参谋长的作用被忽视，很多事情上发言也显得毫无意义，逐渐形成了一个强弱分明的局面，参谋长备受信赖，副参谋长则相对尴尬。作为亲身经历这一切的孙毅，内心的难受程度恐怕只有少数人能够理解。

尽管如此，孙毅在副参谋长的位置上工作并不长，仅仅半年后便被调到军校部任职。虽然他起初是以参谋长的身份进入这个角色，真正投身于前线作战的机会并不多。他对军事教育的热忱始终未变，调至军校部后，能够充分发挥他的专业知识和才能，至少这一变化比担任副参谋长更能体现他的价值。